本片描述几个少年，在数码科幻世界里的冒险和奋战的过程。故事是以七个小孩漂流到数码世界为开端，太一等突然被放逐到一个同时存在山、川、冰、河、热带雨林的谜一样的岛屿，在此与一直在等待太一一群人的七只幼年期的数码宝贝相遇。他们的旅程前方却充满着危机！接连不断而来的数码宝贝们的混战和数码世界之谜，以及阻碍着太一他们前进的恶敌！数码宝贝的世界和人类的世界，跨越两个世界

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在纽约出现了一只神秘的数码兽，他利用自己特殊的力量将太一、阿和、阿空、光子郎、美美、阿丈带到了一个陌生的世界。同时，在纽约的八神光和高石武发现了这只数码兽，并且看到一个美国小孩与数码兽对话之后逃走的情况。巴达兽悄悄地尾随其后，得知这个小孩要去一个叫“花场”的地方寻找“夏天的回忆”。大家赶至那里。 收到小光的电子邮件的大辅他们马上坐飞机来到了美国......

主角为大门大，初二学生，搭挡为亚古兽。大门大意外地遇到了亚古兽，两人见面就大打出手，事后亚古兽称大门大为大哥，但是数码特搜部队（DATS）不容许未受其队员管理的数码兽留存在这个世界上，必需送回数码世界，而后汤岛告诉大若加入DATS他就可以跟数码世界的强敌战斗，大因此加入DATS，与淑乃及托玛组成小组，一同解决数码事件。

数码宝贝第六部国语版又译《数码兽合体战争》《数码暴龙合体大作战》《数码宝贝大汇战》，是数码系列的TV动画第六作，数码宝贝第六部国语版全集讲述的是在某一天，工藤大器偶然听到了神秘声音的呼唤，而成为了指挥官，与朋友们一起来到了数码世界中，在那里认识了众多的数码兽同伴。然而他们将要担负起拯救数码世界的重任。为了防止企图称霸数码世界的巴古拉军而努力的收集著各个领域的水晶，令他们意想不到的是在数码世界中除了他们外竟然还有别的人类在数码世界中活跃着…然而，经过东京大决战之后，数码世界落入巴古拉军手中，为了让数码世界重返和平，大器君和高吼兽决定再次回到危机四伏的数码世界中，但是，数码世界已经相比之前的旅程过了几个月，数码世界亦变成了巴古拉军支配下的地狱世界。数码世界被巴古拉军分裂为七个国家（Land），并由七名可怕的巴古拉军将军所统治，而这七名巴古拉军将军就是本新篇章的主要敌人。

松田启人是个稍微有点率真个性极普通的小学五年级男生，现在最喜欢东西就是数码宝贝！对他来说与朋友玩数码宝贝卡片游戏及上课时偷偷地把自己创作数码暴龙画笔记簿上最大乐趣！热爱数码宝贝少年启人某日竟偶然得到了一张能把命运大大改变的以往从未有人见过的不可思议的蓝色卡片——蓝卡！ 　　就在把蓝卡放读卡机读进去瞬间启人眼前冒险之门已经打开了。与接着到访的命运拍档——基尔兽

数码宝贝世界本是由究极天使兽、基路比兽及神圣天女兽 这三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比兽却叛变，　这使得数码世界的平衡受到破坏，并开始崩溃…… 　　古代曾经拯救数码宝贝世界的十斗士现在已不存在。就在这危急的关头，十斗士的斗士精神把新力量给予了另一个世界——现实世界的孩子……神原拓也、源辉二等五位孩子受到神圣天女兽的召唤，进入数码宝贝世界，第六位孩

在被选召的孩子们首次接触数码世界的6年后。2005年的一天，东京港区海面上的波浪在朝阳下摇曳…17岁的高中生八神太一，一如往常用手按停眼前的闹钟，踢开混乱的被铺，低声滴咕下伸展四肢。拉开了窗帘，光线照到桌上一幅“那一天”的集体照上。随后他在“一路顺风，哥哥”的送别声下，骑上自行车出门，奔向那片初夏的青空…现在，冒险再度进化…